Gabedit เป็นอินเตอร์เฟซผู้ใช้แบบกราฟิกที่จะเสียน Molcas, Molpro MPQC และแพคเกจการคำนวณเคมี
รวมถึงสิ่งอำนวยความสะดวก Gabedit กราฟิกสำหรับการสร้างตัวเลือกคำหลักและรายละเอียดโมเลกุลและส่วนการป้อนข้อมูลสำหรับแม้แต่บิดาประเภทการคำนวณที่ทันสมัยที่สุด Gabedit รวมถึงการสร้างโมเลกุลขั้นสูง
คุณสามารถใช้มันได้อย่างรวดเร็วในร่างโมเลกุลและตรวจสอบพวกเขาในสามมิติ คุณสามารถสร้างโมเลกุลโดยอะตอมแหวนกลุ่มกรดอะมิโนและ nucleoside นอกจากนี้คุณยังสามารถอ่านไฟล์จากรูปทรงเรขาคณิต ส่วนใหญ่รูปแบบไฟล์โมเลกุลที่สำคัญได้รับการสนับสนุน
Gabedit รวมถึงการเสียน Molcas, Molpro และ MPQC คำนวณหน้าต่างติดตั้งซึ่งจะช่วยให้คุณสามารถตั้งค่าเสียน Molcas, Molpro และงาน MPQC ในลักษณะที่ง่ายและตรงไปตรงมา
Gabedit รวมถึงโปรแกรมแก้ไขข้อความสำหรับการแก้ไข Molcas, Molpro, เสียนและ MPQC ใส่ไฟล์
Gabedit กราฟิกสามารถแสดงความหลากหลายของเสียน Molcas, Molpro, MPQC และ (บางส่วน) ผลการคำนวณ ADF รวมถึงต่อไปนี้:
ยท orbitals โมเลกุล
ยทพื้นผิวจากความหนาแน่นของอิเล็กตรอนที่มีศักยภาพไฟฟ้าสถิตความหนาแน่นของการป้องกัน NMR และคุณสมบัติอื่น ๆ
ยทพื้นผิวอาจจะแสดงในของแข็งโปร่งแสงและโหมดลวดตาข่าย
ยทพื้นผิวจะมีสีโดยสถานที่ให้บริการแยกต่างหาก
ยทรูปทรง (colorcoded)
ยทเครื่องบิน (colorcoded)
ยทไดโพล
ยทแกน XYZ และแกนหลักของโมเลกุล
ยทนิเมชั่นในโหมดปกติที่สอดคล้องกับความถี่การสั่น
ยทนิเมชั่นของการหมุนของรูปทรงเรขาคณิตพื้นผิว, ขั้ว, xyz และแกนหลักของโมเลกุล
ยทนิเมชั่นของรูปทรง
ยทนิเมชั่นของเครื่องบิน colorcoded
Gabedit สามารถแสดง IR และรามันคำนวณสเปกตรัม Gabedit สามารถสร้างไฟล์ PovRay เรขาคณิต (อะตอม + พันธบัตรรวมถึงพันธะไฮโดรเจน) ของพื้นผิว (รวมถึงพื้นผิว colorcoded) รูปทรงเครื่องบิน colorcoded
Gabedit สามารถบันทึกภาพใน PPM, BMP, (JPEG) และรูปแบบ PS Gabedit โดยอัตโนมัติสามารถสร้างชุดของภาพสำหรับการเคลื่อนไหว (การสั่นสะเทือนบรรจบเรขาคณิตหมุนรูปทรงเครื่องบิน colorcoded)
มีอะไรใหม่ ในข่าวประชาสัมพันธ์นี้:
- ข้อบกพร่องเล็ก ๆ น้อย ๆ ได้รับการแก้ไข.
- NWChem ได้รับการสนับสนุนในขณะนี้.
- Windows เกมพื้นเมืองได้รับการสนับสนุนในขณะนี้.
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.3.5:.
- ข้อบกพร่องเล็ก ๆ น้อย ๆ ได้รับการแก้ไข
- อะตอมสามารถแก้ไขได้ในระหว่างการจำลองการเปลี่ยนแปลงโมเลกุล.
- การย้ายถิ่นจากไคโร OpenGL สำหรับการวาดภาพหน้าต่างเรขาคณิต.
- การย้ายถิ่นจาก gtkglarea เพื่อ GtkGLExt.
- parallelization ใช้ OpenMP.
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.3.0:.
- ข้อบกพร่องเล็ก ๆ น้อย ๆ ได้รับการแก้ไข
- ผู้ใช้สามารถอ่าน orbitals เรขาคณิตและโหมดปกติจากไฟล์เสียน fchk.
- หนึ่งสามารถอ่าน orbitals จาก aux Mopac ใหม่รูปแบบไฟล์ (รวมทั้งรูปแบบการบีบอัด).
- เลือกใหม่ในหลาย XYPlot และหน้าต่าง ContoursPlot (ข้อความใส่เส้นลูกศร, ภาพ, รูปแบบใหม่ ... ).
- ความยาวพันธบัตรสามารถแก้ไขได้ในระหว่างการจำลอง MD.
- การเพิ่มประสิทธิภาพบางส่วนอยู่ในขณะนี้เป็นไปได้ด้วยศักยภาพ MM.
- การดำเนินงานของเครื่องมือที่จะคาดการณ์ฝูงและปริมาณของไอโซโทปสำหรับโมเลกุลที่กำหนด การดำเนินงานของเครื่องมือในการคำนวณ electrophilic, ไว nucleophilic และรุนแรงสำหรับโมเลกุล.
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.2.0:
- ข้อบกพร่องเล็ก ๆ น้อย ๆ ได้รับการแก้ไข
- การเปลี่ยนแปลงทั้งหมดเรขาคณิตสามารถยกเลิกการใช้ซ้ำและเลิกทำและทำซ้ำ (u / U หรือ Ctrl z / Ctrl Y)
- ผู้ใช้มีการควบคุมที่สมบูรณ์มากกว่าพันธบัตรที่แสดงในรูปวาด.
- การวาดภาพของอะตอมโมเลกุลจากอะตอมได้ง่าย.
- ภาพวาดของโมเลกุลส่วนโดยส่วนได้ง่าย.
- Gabedit อ่าน connectivities จาก gabedit, ฮิน, PDB, mol2 และไฟล์ mol.
- ผู้ใช้สามารถตั้งค่าของระยะทางที่มุมพันธบัตรและมุมไดฮีดรั.
- การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างโมเลกุลการค้นหาจะดำเนินการใช้ศักยภาพ MM (แอมเบอร์ 99).
- การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างโมเลกุลการค้นหาจะดำเนินการใช้วิธีกึ่งเชิงประจักษ์ (จากเปิด Mopac หรือ PCGamess).
- การย้ายถิ่นจากฟังก์ชั่นการวาดภาพ GDK ไปยังกรุงไคโร:. ข้ามอุปกรณ์แสดงผลสำหรับกราฟิกแบบเวกเตอร์
- ไคโรถูกนำมาใช้ในขณะนี้สำหรับเครื่องมือ XYplot gabedit (ใช้สำหรับวาด gabedit สเปกตรัม).
- ไคโรตอนนี้ใช้สำหรับหน้าต่างวาดภาพเรขาคณิต.
- เรขาคณิตสามารถส่งออกใน EPS, PS, PDF หรือไฟล์ SVG.
- เส้นโค้งของหน้าต่าง XYplot สามารถส่งออกใน EPS, PS, PDF หรือไฟล์ SVG.
- เครื่องมือใหม่สำหรับการคำนวณระยะทางระหว่าง 2 จุดบนหน้าต่าง XYPlot & quot; ปุ่ม Control + กะ & quot; สามารถใช้สำหรับการทำซูมบนหน้าต่าง XYPlot.
- รุ่นใหม่ของ PCGamess (หิ่งห้อย) ได้รับการสนับสนุนในขณะนี้
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.1.13:
- ข้อบกพร่องเล็ก ๆ น้อย ๆ เป็น fixe
- การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างโมเลกุลการค้นหาจะดำเนินการใช้ศักยภาพ MM (แอมเบอร์ 99).
- การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างโมเลกุลการค้นหาจะดำเนินการใช้ศักยภาพกึ่งเชิงประจักษ์ (โดยใช้ Mopac หรือ PCGAMESS).
- หนึ่งสามารถเพิ่มประสิทธิภาพของรูปทรงเรขาคณิตที่ใช้โต้ตอบ Mopac หรือ PCGamess วิธีกึ่งเชิงประจักษ์จากหน้าต่างวาดเรขาคณิต
- การย้ายถิ่นจากฟังก์ชั่นการวาดภาพ GDK ไปยังกรุงไคโร: ข้ามอุปกรณ์แสดงผลสำหรับกราฟิกแบบเวกเตอร์ ไคโรถูกนำมาใช้ในขณะนี้สำหรับเครื่องมือ XYplot gabedit (ใช้สำหรับวาด gabedit สเปกตรัม) ไคโรตอนนี้ใช้สำหรับหน้าต่างวาดภาพเรขาคณิต.
- เรขาคณิตสามารถส่งออกใน EPS, PS, PDF หรือไฟล์ SVG เส้นโค้งของหน้าต่าง XYplot สามารถส่งออกใน EPS, PS, PDF หรือไฟล์ SVG.
- เครื่องมือใหม่สำหรับการคำนวณระยะทางระหว่าง 2 จุดบนหน้าต่าง XYPlot & quot; Control + ปุ่มซ้าย & quot; สามารถใช้สำหรับการทำซูมบนหน้าต่าง XYPlot.
- รุ่นใหม่ของเครื่องคอมพิวเตอร์ GAMESS / หิ่งห้อยได้รับการสนับสนุนในขณะนี้
ต้องการ
- GTK +
ความคิดเห็นที่ไม่พบ