ภาพหน้าจอของซอฟแวร์:
รายละเอียดซอฟแวร์:
โครงการมาร์วินมีคอลเลกชันของเครื่องมือ Java สำหรับการวาดภาพ, การแสดงและการพัฒนาการโครงสร้างทางเคมี, substructures และปฏิกิริยา
มาร์วินสามารถติดตั้งได้อย่างง่ายดายบนเดสก์ทอปของคุณและบูรณาการต่อเนื่องในหน้าเว็บและโปรแกรมของบุคคลที่สามผ่านอินเตอร์เฟซของโปรแกรมประยุกต์ (API)
ครอบครัวมาร์วินประกอบด้วยเครื่องมือต่อไปนี้:
* MarvinSketch
* MarvinView
* MarvinSpace
* MolConverter
แอปเพล็หรือถั่ว?
มาร์วินสามารถใช้ได้ในสองแพคเกจขึ้นอยู่กับการใช้งาน:
* มาร์วินแอปเพล็สำหรับนักพัฒนาเว็บ
* มาร์วินถั่วสำหรับเดสก์ทอปของนักเคมีและนักพัฒนาซอฟต์แวร์
มาร์วินแอปเพล็เป็นเครื่องมือสำหรับการสร้างสารเคมีที่หน้าเว็บที่มีความเข้ากันได้กับเบราว์เซอร์ส่วนใหญ่ (Internet Explorer, Firefox, Safari, Opera ฯลฯ ) พวกเขานำเสนอการเข้าถึงจาก / ถึง JavaScript และมีการปรับแต่งโดยแอปเพล็พารามิเตอร์
ถั่วมาร์วินเป็นโปรแกรมที่สามารถติดตั้งได้อย่างง่ายดายสำหรับเดสก์ทอปและเครื่องมือสำหรับการบูรณาการความสามารถในการเป็นมาร์วินใด ๆ โปรแกรม Java
มีอะไรใหม่ ในข่าวประชาสัมพันธ์ฉบับนี้.
- MarvinSketch:
- ค้นหาฐานข้อมูลของประชาชนใน chemicalize.org.
- ความเป็นไปได้ที่จะเปลี่ยนแปลงคำสั่งแกนด์ใน MarvinSketch.
- หมอกผลกระทบสามารถควบคุมได้ในรูปแบบต่างๆ:
- มีตัวเลื่อนบนแท็บการแสดงการตั้งค่าการโต้ตอบในเขียนแบบ / ดู GUI เพื่อกำหนดความแข็งแรงของหมอกผลกระทบและช่องปิดหมอกผลอัตโนมัติ.
- Applet และถั่วพารามิเตอร์แนะนำ: fogFactor, automaticFogEnabled (หัวข้อฟอรั่ม).
- การเชื่อมต่อไปยังจุดที่แนบมากลุ่มไม่ได้โดยอัตโนมัติ ungroup Sgroup อีกต่อไป.
- การวิเคราะห์หาปริมาณ S-กลุ่ม:. หลายคนและทั่วไป S-กลุ่มจะต้องมีทั้ง subgraph ระหว่างพันธบัตรข้ามวงเล็บ
- ปรับปรุงเนื้อหา S-กลุ่มถ้าตำแหน่งวงเล็บเปลี่ยนทั้งวงเล็บหรือโครงสร้างจะถูกย้ายไป .
- การฝัง S-กลุ่มและการทับซ้อนกันมีการตรวจสอบที่ตรวจสอบความสอดคล้องโมเลกุล.
- SMARTS นำเข้าสนับสนุนก๊อบปี้สารประกอบที่มีพันธะคู่ (หัวข้อฟอรั่ม).
- SMILES นำเข้า / ส่งออกสนับสนุน allenes.
- สร้างชื่อแบบดั้งเดิมสำหรับชิ้นส่วนภายในสารประกอบขนาดใหญ่ (เช่น & quot; Dextromethorphan hydrobromide & quot;).
- การสนับสนุนสำหรับการแปลงหมายเลข CAS.
- การปรับปรุงแก้ไขข้อผิดพลาดใน DocumentExtractor OCR (จุลภาคหายไปชนิดวงเล็บ misrecognized พื้นที่พิเศษ ... ).
- เอกสารดูดในเอกสาร PDF ในขณะนี้จะช่วยให้จำนวนหน้าของฮิต.
- การสนับสนุนที่ดีขึ้นสำหรับชื่อสามัญในโครงสร้างให้ชื่อและที่ชื่อกับโครงสร้าง การสนับสนุนทั่วไปสำหรับการนำเข้าชื่อเพิ่มขึ้นประมาณ 5% สำหรับการร่วมกันและ 10% สำหรับชื่ออย่างเป็นระบบ ความเร็วในการแปลงเพิ่มขึ้นประมาณ 20%.
- Jchem และมาร์วินถั่วติดตั้งสำหรับ Windows นอกจากนี้ยังแยกเชลล์สคริปต์สำหรับ Cygwin.
- กลุ่มอนุรักษ์ exocycyclic ในกรอบมิส-Murcko.
- ฮาโลเจนสามารถมีมากกว่าหนึ่งการเชื่อมต่อระหว่างการนับ.
- พันธบัตรหอมได้รับการพิจารณาในระหว่างการคำนวณจำนวนของพันธะคู่สำหรับการตรวจสอบสถานที่ให้บริการที่คล้ายคลึงกัน.
- โหมดการเลือกเชือกสามารถตั้งค่าให้เป็นค่าเริ่มต้นใน MSketchPane (หัวข้อฟอรั่ม).
- ฟังก์ชั่นใหม่ isChiral ได้รับการเพิ่ม TopologyAnalyzer.
- ฟังก์ชั่นใหม่ข้อกำหนด chmical: isQuery () fieldAsString () .
- Bugfixes:
- กล่องชื่อไม่ได้ปรับปรุงหลังจากการสร้างกลุ่มเพราะสร้างกลุ่มไม่ได้เพิ่มจำนวนการเปลี่ยนแปลงคงที่กราฟ (หัวข้อฟอรั่ม).
- การประยุกต์ใช้ MarvinSketch ไม่เข้าใจ & quot; - {name} & quot; พารามิเตอร์บรรทัดคำสั่ง.
- เมื่อโครงสร้าง & gt; ค้นหาโครงสร้างเมนูออนไลน์ถูกเรียกภายใต้ Linux, เบราว์เซอร์เริ่มต้นไม่สามารถตรวจพบในการแสดงผล (หัวข้อฟอรั่ม).
- การโหลดไฟล์ isotopes.data จากแคช java ล้มเหลวหากรุ่นไม่มีการบีบอัดของมันถูกเก็บไว้ในแคช (เช่นถ้า uncompression ได้กระทำโดยอัตโนมัติโดยเว็บเซิร์ฟเวอร์และไม่โดยมาร์วิน) ฟอรั่มหัวข้อเอกสาร.
- วัตถุกราฟิกที่ไม่ได้แสดงในปลั๊กอินเรขาคณิตหน้าต่างผล.
- บนลูกศรอิเล็กตรอนไหล, กล่องสีฟ้าสำหรับไฮไลต์ที่พลาด (หัวข้อฟอรั่ม).
- คำสั่งแกนด์ก็ไม่ได้แสดงบนนั่งร้านถ้าคำจำกัดความถูกลบแม้ว่า & quot; เสมอ & quot; ตัวเลือกการแสดงถูกกำหนดให้ & quot; คำสั่งแกนด์ & quot; ในการตั้งค่าการโต้ตอบ.
- ดัชนีอะตอม multicenter กลายเป็นความเสียหายหลังจากการส่งออกในรูปแบบ MDL โมเลกุลถ้ามันถูกเชื่อมต่อกับ R-กลุ่ม.
- ลูกศรติดอยู่กับรูปสี่เหลี่ยมได้รับความเสียหายในระหว่างการนำเข้า Mrv / ส่งออก (หัวข้อฟอรั่ม).
- นำเข้าของเปปไทด์ 1 ตัวอักษรที่ล้มเหลวใน Histidine เดียว (หัวข้อฟอรั่ม).
- ไฮโดรเจนโดยปริยายหายไปโดยการนำเข้าจาก SKC.
- มูลค่าทรัพย์สิน Null ของ MolAtom ไม่ได้ส่งออก / นำเข้าในรูปแบบ Mrv.
- โดยการนำเข้า SMARTS บางประเภทตราสารหนี้ที่ไม่ถูกต้องถูกกำหนดแทนพันธบัตรเดียวหรือมีกลิ่นหอม.
- วงเล็บบางอย่างที่นำเข้าจากไฟล์ Cdx วาดใน ChemDraw มีการแสดงผลในทิศทางที่ผิด.
- SMARTS ส่งออก: 1. อะตอมเพื่อนบ้านพันธบัตรเดียวของหอมแหวนได้รับการส่งออกเป็นพันธบัตรเดียวแทนเดียว / หอม
- การส่งออกคำสั่งกับโหนดเชื่อมโยงและ R กลุ่มในรูปแบบ SMARTS ไม่ถูกต้อง.
- การจัดการอะตอม H เป็นที่คลุมเครือในการแสดงออก SMARTS.
- ไฟล์ Mol การแสดงความคิดเห็นนำเข้าข้อมูลล้มเหลว.
- นำเข้าแห่งรอยยิ้มบางอย่างที่ผิด (หัวข้อฟอรั่ม).
- หากเทมเพลทที่มีส่วนหนึ่งของห่วงโซ่ที่สามารถจะอยู่ในเป้าหมายที่เป็นส่วนหนึ่งของแหวน (หรือระบบวงแหวน) เราควรละเลยส่วนหนึ่งของแม่แบบที่.
- ปรับกับตัวเลือกของ Hydrogenize Clean3D ไม่ได้ยกเลิกการจัดกลุ่ม S-กลุ่มโดยอัตโนมัติ (หัวข้อฟอรั่ม).
- Molecule.contractSgroups () messed up พิกัดโมเลกุล (หัวข้อฟอรั่ม).
- ไฮโดรเจนที่ชัดเจนไม่ได้ถูกนำเข้าบัญชีอย่างถูกต้องใน Cis / ทรานส์คำนวณสเตอริโอ.
- กำเนิด Tautomer โยน ArrayIndexOutOfBoundsException ในบางกรณี.
- การนับคล้ายคลึงกันผลิตโมเลกุลที่ไม่สอดคล้องกันสำหรับการป้อนข้อมูลบาง VMN.
- นับค่าใช้จ่ายที่ไม่ถูกต้องหลังจากใช้ CovalentCounterion ผู้ให้บริการ.
- รูปแบบการออกบันทึกบรรทัดคำสั่ง StructureChecker แตกต่างจากรูปแบบการออกของวิซาร์ด.
- ChiralFlagErrorChecker ไม่ได้จัดการ chirality ได้อย่างถูกต้อง แทนการคำนวณ chirality จากข้อมูลเท่าเทียมกันที่จะใช้ในการดำเนินการตามวิธีการของ isChiral TopologyAnalyser.
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 5.4.0.1:
- Highlighting ของลูกศรไหลของอิเล็กตรอนถูกผิดเมื่อฐาน หรือจุดสิ้นสุดเป็นพันธบัตร (หัวข้อฟอรั่ม).
- การตั้งค่าเมนูเนื่องไม่ได้ทำงาน.
- ดัชนีของอะตอม multicenter ถูกสร้างขึ้นอย่างไม่ถูกต้องในระหว่างการส่งออก MDL MOLFile ในกรณีของโครงสร้างที่ R-กลุ่มที่เชื่อมต่อกับอะตอม multicenter (พันธบัตรเปลี่ยนแปลงตำแหน่ง).
- ไฮโดรเจนโดยปริยายหายไปจากอะตอมหลังจากที่นำเข้าหรือวางของโครงสร้างใน ISIS / Symyx รูปแบบไฟล์ภาพร่าง (รูปแบบไฟล์ SKC).
- ไฟล์ CDX รวมทั้งวัตถุกราฟิกหมุนที่ส่งออกจากรุ่นเก่าของ ChemDraw ไม่สามารถนำเข้า.
- การคำนวณ Tautomer
- tautomer ทั่วไปก็ไม่มากพอที่ไม่ซ้ำกันในบางกรณี เนื่องจากการแก้ไข tautomer ทั่วไปมีให้รูปแบบที่มีกลิ่นหอม.
- Canoncical คำนวณ tautomer ได้รับการปรับปรุงให้ดีขึ้นเนื่องจากการแก้ไขปัญหาของ dearomatization.
- โครงสร้างบางอย่างที่มีไฮโดรเจนอย่างชัดเจนเชื่อมต่อกับพันธบัตรลิ่มให้ยกเว้นในช่วง tautomerization ทั่วไป.
- การคำนวณปริมาณที่ขาดหายไปจาก cxcalc.
- ตรวจสอบโครงสร้างโยน NullPointerException แทนการละเลยแฟ้มการกำหนดค่าที่ไม่ถูกต้อง.
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 5.1.03.2:
- IUPAC ชื่อนำเข้า: การแปลงชื่อ IUPAC กับโครงสร้าง
- OLE 2 สนับสนุน:. สนับสนุนที่ดีขึ้นของการวาง MarvinSketch วัตถุลงใน MS เอกสารสำนักงาน
- ข้อตกลงการใช้สารเคมี:. พร้อมใช้งานจากมาร์วินในบรรทัดคำสั่ง API และสามารถนำมาใช้ในสคริปต์ Java (ใน applets)
- การเริ่มต้นของการเร่ง MarvinSketch และ MarvinView ที่เริ่มต้นทั้งสองเป็นเวอร์ชั่นสแตนด์อโลนและเป็นองค์ประกอบที่นำมาใช้ในโปรแกรมอื่น ๆ .
ต้องการ
- Java 2 Standard Edition Runtime Environment
ความคิดเห็นที่ไม่พบ