Bioinformatics Benchmark System

ภาพหน้าจอของซอฟแวร์:
Bioinformatics Benchmark System
รายละเอียดซอฟแวร์:
รุ่น: 3
วันที่อัพโหลด: 3 Jun 15
ผู้พัฒนา: Joe Landman
การอนุญาต: ฟรี
ความนิยม: 8

Rating: 4.0/5 (Total Votes: 1)

ชีวสารสนเทศศาสตร์ระบบเกณฑ์มาตรฐานเป็นความพยายามที่จะสร้างกรอบการทดสอบที่เหมาะสม, การทดสอบและข้อมูลที่จะช่วยให้ผู้ใช้และผู้ขายในการตรวจสอบประสิทธิภาพการทำงานของระบบของพวกเขา
สิ่งที่เรากำลังพยายามที่จะทำคือการสร้างกรอบการทำงานสำหรับการทดสอบและชุดหลักของการทดสอบว่าทั้งหมดสามารถดาวน์โหลดและใช้ในการตรวจสอบองค์ประกอบที่เฉพาะเจาะจงของผลการดำเนินงานระบบ
นอกจากนี้แหล่งที่มาเพื่อการทดสอบเหล่านี้ที่มีอยู่ภายใต้ GPL และโฮสต์บน Bioinformatics.org และปรับขนาดสารสนเทศ LLC ความคิดที่จะช่วยให้ผู้ใช้ผู้บริโภคนักพัฒนาระบบและอื่น ๆ เพื่อให้ง่ายต่อการสร้างและใช้การทดสอบที่มีความหมายสำหรับการวัดและเหตุผลการปรับแต่ง .
โจแลนด์จาก Scalable สารสนเทศ LLC ความคิดและเขียนรหัสต้นฉบับ เรากำลังมองหาข้อเสนอแนะเพิ่มเติมรหัสมาตรฐานการทดสอบชุดข้อมูลและอื่น ๆ
การทดสอบพื้นฐานปัจจุบันมีหลาย NCBI ระเบิดวิ่งวิ่ง HMMer หลายและความหลากหลายของคนอื่น ๆ เราวางแผนที่จะรวม ClustalW, X ตีคู่! เคมีต่าง ๆ การเปลี่ยนแปลงและการทดสอบที่เกี่ยวข้องเช่นเดียวกับคนอื่น ๆ หลาย
การทดสอบดังกล่าวเป็น LINPACK หรือ HPL ก็ไม่ได้ให้ตัวชี้วัดประสิทธิภาพที่มีความหมายหรือรูปแบบการพยากรณ์สำหรับสารสนเทศที่มีประสิทธิภาพสูง แต่น่าเสียดายที่ไม่ทำจำนวนของการทดสอบที่ผ่านมาและมุ่งเน้นมากขึ้น
ปัญหานี้เป็นปัญหาและเป็น LINPACK HPL เฉพาะทดสอบประสิทธิภาพในการดำเนินงานต่างๆเมทริกซ์ที่คุณมีรูปแบบการเข้าถึงหน่วยความจำปกติได้อย่างมีประสิทธิภาพและดำเนินการทางคณิตศาสตร์ที่เฉพาะเจาะจง
รหัสเหล่านี้มีประโยชน์มากที่สุดสำหรับการเปรียบเทียบรหัสกับการดำเนินงานจุดลอยหนักและการจราจรอัดหน่วยความจำ รหัสเหล่านี้ไม่ได้ถูกออกแบบมาสำหรับการเปรียบเทียบระบบที่ครอบคลุมที่ดิสก์ I / O แฝงหน่วยความจำและปัจจัยอื่น ๆ ทั้งหมดนำไปสู่​​ปัญหาประสิทธิภาพการทำงาน
การทดสอบที่ดีที่สุดคือคนที่มีความใกล้เคียงกับรหัสที่คุณจะทำงานบนเครื่อง การทดสอบตัวเองควรจะใกล้เคียงที่เหมาะสมเพื่อการดำเนินการที่แท้จริงของรหัสของคุณโดยใช้ข้อมูลจริง คุณอาจจำเป็นต้องตัดมันกลับมาเพื่อที่จะได้ระยะเวลาที่เป็นจริง
คุณควรจะมีส่วนย่อยที่เหมาะสมของขนาดข้อมูล ทดสอบเดียวไม่บอกคุณว่าระบบของคุณเครื่องชั่งน้ำหนักและเป็นหนึ่งในสาเหตุของการดำรงอยู่ของการทดสอบนี้เป็นพิเศษเพื่อให้คุณสามารถทดสอบประสิทธิภาพในขณะที่คุณเพิ่มแง่มุมต่าง ๆ ของภาระงาน
คุณไม่ค่อยได้รับระบบนิ่งในคลัสเตอร์ดังนั้นเราจึงอยากจะแนะนำให้คุณพยายามที่จะทำงานในเป็นจริงสภาพแวดล้อมการทำงานที่เป็นไปได้ พื้นฐานในระบบนิ่งดี แต่มันอาจจะตั้งความคาดหวังของคุณโดยไม่มีเหตุผลสมควร
ด้านบน

ซอฟต์แวร์ที่คล้ายกัน

tigreBrowser
tigreBrowser

11 May 15

MetagenomeDB
MetagenomeDB

12 May 15

MacMolPlt
MacMolPlt

2 Jun 15

ความคิดเห็นที่ Bioinformatics Benchmark System

ความคิดเห็นที่ไม่พบ
เพิ่มความคิดเห็น
เปิดภาพ!
ค้นหาตามหมวดหมู่