BioRuby ให้สภาพแวดล้อมแบบบูรณาการสำหรับชีวสารสนเทศศาสตร์ (ชีววิทยาวิทยาศาสตร์ข้อมูล)
สคริปต์ที่มุ่งเน้นวัตถุภาษาทับทิมมีคุณสมบัติหลายอย่างที่เหมาะสมสำหรับการวิจัยชีวสารสนเทศตัวอย่างเช่นไวยากรณ์ที่ชัดเจนในการแสดงวัตถุที่ซับซ้อน, การแสดงออกปกติสำหรับการจัดการข้อความที่มีประสิทธิภาพเป็น Perl & rsquo; s ที่หลากหลายของห้องสมุดรวมถึงการบริการเว็บอื่น ๆ
ในฐานะที่เป็นไวยากรณ์ทับทิมเป็นเรื่องง่ายและสะอาดมากเราเชื่อว่ามันเป็นเรื่องง่ายที่จะเรียนรู้สำหรับผู้เริ่มต้นใช้งานง่ายสำหรับนักชีววิทยาและยังมีประสิทธิภาพเพียงพอสำหรับนักพัฒนาซอฟแวร์
ใน BioRuby นักพัฒนาสามารถดึงข้อมูลใหม่ทางชีวภาพจากไฟล์แบนเว็บเซิร์ฟเวอร์อินเทอร์เน็ตและฐานข้อมูลเชิงสัมพันธ์ในท้องถิ่น
รายการฐานข้อมูลเหล่านี้สามารถแยกวิเคราะห์เพื่อดึงข้อมูลที่คุณต้องการ ลำดับชีวภาพสามารถรักษาได้ด้วยวิธีการตอบสนองของทับทิม & rsquo; s คลาสสตริงและมีการแสดงออกปกติ
ห้องสมุดที่สามารถบูรณาการกับเครื่องมือเช่นระเบิด Fasta, Hmmer และซอฟแวร์อื่น ๆ อีกมากมายสำหรับการวิเคราะห์ทางชีวภาพ
BioRuby สนับสนุนรูปแบบฐานข้อมูลทางชีวภาพที่สำคัญและมีหลายวิธีในการเข้าถึงพวกเขาผ่านการจัดทำดัชนี Flatfile, SQL, บริการเว็บ ฯลฯ บริการเว็บต่างๆรวมทั้ง KEGG API สามารถนำไปใช้อย่างง่ายดายโดย BioRuby.
คุณสมบัติ
- BioRuby เปลือก
- API
- เอกสาร
ต้องการ
- ทับทิม 1.8.7 หรือสูงกว่า
ความคิดเห็นที่ไม่พบ