โทรศัพท์มือแม่เหล็กจำลองสิ่งแวดล้อม (CESE) เป็นกรอบที่ครอบคลุมการออกแบบมาโดยเฉพาะเพื่อดำเนินการจำลอง electrophysiological คอมพิวเตอร์เช่นการจำลองการเต้นของหัวใจของ myocyte กิจกรรมไฟฟ้า
สิ่งแวดล้อมเซลล์แม่เหล็กจำลองจะเป็นประโยชน์สำหรับการจำลองของศักยภาพการกระทำกระแสอิออนของแต่ละบุคคลและการเปลี่ยนแปลงในความเข้มข้นของอิออน
CESE เป็นโปรแกรมข้ามแพลตฟอร์มจะทำงานบนระบบที่มีสภาพแวดล้อมรันไทม์ Java ใด ๆ (JRE) เวอร์ชั่น 1.4 หรือสูงกว่า มันได้รับการทดสอบบน Windows, Linux, Solaris, MacOS X และ AIX
ผู้ใช้ CESE
CESE เป็นสภาพแวดล้อมแบบบูรณาการสำหรับการดำเนินการจำลองการคำนวณโดยใช้ความหลากหลายของรูปแบบ electrophysiological
ที่ CESE ขั้นตอนนี้ช่วยให้การสร้างและการดำเนินการในรูปแบบเดียวเซลล์ (ที่มีทั้ง-Hodgkin ฮักซ์ลีย์ (HH) และมาร์คอฟสูตรปัจจุบัน) รูปแบบของกิจกรรมทางไฟฟ้าของหัวใจ myocytes กับรหัสแหล่งที่มาจะรวมอยู่ในการจัดจำหน่าย CESE เราหวังที่จะขยายจำนวนของรูปแบบที่มีอยู่และเพิ่มรูปแบบเส้นประสาทบางอย่างในอนาคต
กำลังหลักของ CESE อยู่ในความสม่ำเสมอของ & # 65533; อินเตอร์เฟซโปรแกรมยังคงเหมือนเดิมชนิดที่แตกต่างกันของรูปแบบ คุณสามารถสลับไปมาระหว่างรูปแบบและเปรียบเทียบผลการจำลอง พารามิเตอร์แบบสามารถแก้ไขได้เลือกสำหรับการส่งออกและ / หรือยึดในเดียวกันวิธีมาตรฐาน
CESE ขยายความหมายธรรมดา electrophysiological ของ "ยึดแรงดัน" คุณสามารถยึดแทบตัวแปรรูปแบบใด ๆ รวมทั้งแรงดันไฟฟ้า (เมมเบรนที่มีศักยภาพ) กระแสไอออนิกรวมหรือบุคคลที่ความเข้มข้นของอิออนอุณหภูมิตัวแปร gating ฯลฯ คำสั่งหนีบสามารถเป็นฟังก์ชั่นชิ้นที่ชาญฉลาดที่ซับซ้อนตั้งเป็นรายบุคคลสำหรับตัวแปรที่น่าสนใจรูปแบบ . นี้จะเปิดความเป็นไปได้ไม่มีที่สิ้นสุดสำหรับการสำรวจพฤติกรรมของรูปแบบที่ซับซ้อน
CESE ให้เรียบง่าย แต่มีประสิทธิภาพการสร้างภาพข้อมูล ผลการจำลองสามารถนำเสนอในรูปแบบกราฟิกและตาราง พล็อตที่สามารถปรับแต่งและภูมิภาคที่น่าสนใจซูม
แม้ว่า CESE ไม่ได้ออกแบบมาเพื่อเป็นเครื่องมือในการวิเคราะห์ข้อมูลที่คุณสามารถสร้างความสัมพันธ์ในปัจจุบันแรงดัน (I-Vs) และคำนวณค่าพารามิเตอร์ทางสถิติสำหรับการรับสัญญาณภายในโปรแกรม คุณสามารถส่งออกข้อมูลของคุณไป ASCII, แฟ้มข้อความ Axon (เอทีเอฟ) และรูปแบบ NetCDF เพื่อดำเนินการต่อการวิเคราะห์ในแพคเกจที่คุณชื่นชอบ
นักพัฒนา CESE
CESE ถูกสร้างขึ้นจากพื้นดินขึ้นที่จะรวมการเขียนโปรแกรมที่ดีที่สุดที่มีการพัฒนา Java ทั้งในแง่ของความมั่นคงอินเตอร์เฟซผู้ใช้และรหัสความชัดเจนและนำมาใช้ หากเป็นไปได้ CESE พึ่งพา APIs ใช้ได้ Java (เช่นเจ๊ด Java2D, JavaBeans, JAXP) เพื่อลดความซับซ้อนของรหัส
การสร้างรุ่นต้องใช้จำนวนของฟังก์ชั่นบ้านเก็บที่จะเขียน & # 65533; เหล่านี้รวมถึงผู้ติด ODE ประจำสำหรับการจัดการพารามิเตอร์แบบประหยัด / กู้คืนสถานะรูปแบบการแสดงผลการจำลอง ฯลฯ CESE ให้คุณกับการดำเนินการสำหรับการปฏิบัติเหล่านี้ดังนั้นคุณสามารถมีสมาธิในการเขียนโค้ดสำหรับปัจจุบันอิออนที่เป็นรูปธรรม (s) และ CESE จะจัดการส่วนที่เหลือ
CESE ไม่ได้พยายามที่จะสร้างกรอบการเขียนโปรแกรมที่มีความซับซ้อนในตัวเอง & # 65533; ค่อนข้างจะใช้ APIs Java หลัก ตัวอย่างเช่นรุ่นเป็นส่วนประกอบ Java ที่สอดคล้องกับข้อกำหนด JavaBeans เราใช้ XML เพื่อระบุคำสั่งหนีบและเป็นอันดับวัตถุ Java เพื่อบันทึก / เรียกคืนพารามิเตอร์แบบ
มีอะไรใหม่ในรุ่นนี้:
ความคิดเห็นที่ไม่พบ