InterMine

InterMine ให้ขั้นตอนการเข้าถึงข้อมูลคลังสินค้าขับเคลื่อนโดยเทคโนโลยี InterMine
InterMine เป็นโอเพนซอร์สที่มีประสิทธิภาพของระบบคลังข้อมูล ใช้ InterMine คุณสามารถสร้างฐานข้อมูลของข้อมูลทางชีวภาพเข้าถึงได้โดยเครื่องมือค้นหาเว็บที่มีความซับซ้อน Parsers มีไว้สำหรับการบูรณาการข้อมูลจากรูปแบบทางชีวภาพหลายที่พบบ่อยและมีกรอบการทำงานสำหรับการเพิ่มข้อมูลของคุณเอง InterMine รวมถึงเสน่ห์, เว็บอินเตอร์เฟสที่ใช้งานง่ายที่ทำงาน 'ออกจากกล่อง' และสามารถปรับแต่งได้อย่างง่ายดายสำหรับความต้องการของคุณ
รหัส InterMine ทั้งหมดเป็นอิสระที่มีอยู่ภายใต้ใบอนุญาต LGPL

มีอะไรใหม่ ในข่าวประชาสัมพันธ์ฉบับนี้.

• การเชื่อมโยงในการ InterMine:
• มีวิธีการใหม่ ๆ ที่จะเชื่อมโยงเข้าไปในเหมืองของคุณ ดูลิงค์สำหรับรายละเอียด.
• บริการเว็บรูปแบบ JSON:
• มีหลายรูปแบบใหม่เว็บเซอร์ผล เข้าร่วม jsonobjects ที่ปรากฏใน 0.95 ตอนนี้เรามีรูปแบบ JSON สำหรับทุกอย่างสวยมากอื่น:
• ผลประกอบการ:
• jsonrows - การแสดงตารางของข้อมูลที่มีข้อมูล meta พิเศษ
• & quot; jsontable & quot; . - รูปแบบภาชนะสำหรับการสร้างแม่แบบฝังตัว (ดู: กวดวิชา Imbedding)
• & quot; นับ & quot; และ & quot; jsoncount & quot; - รูปแบบเพียงได้รับการนับของแบบสอบถาม
• Webservice เมตาข้อมูล (รุ่นและแม่แบบ):
• & quot; JSON & quot; - รุ่นได้อย่างง่ายดาย parsable ของรูปแบบข้อมูลและรายชื่อแม่แบบที่มีอยู่
• การตรวจสอบขณะนี้การทำงานใน Perl Webservice ลูกค้า:
• ผู้ใช้ของลูกค้า Perl Webservice ตอนนี้มีโปรแกรมการเข้าถึงไปยังรายการและแม่แบบส่วนตัวของพวกเขา เพียงแค่ให้รายละเอียดการเข้าสู่ระบบของคุณให้กับลูกค้าในการเข้าถึงบัญชีของคุณ (รายละเอียดของคุณจะถูกส่งในรูปแบบเข้ารหัส) คุณลักษณะนี้จะทำงานร่วมกับการทำเหมืองแร่ทั้งหมดที่มี WebServices ไม่เพียง แต่ผู้ที่ 0.96 และสูงกว่า.
• ผลวัตถุกับลูกค้า Webservice:
• Perl และ Java ลูกค้าสามารถที่จะได้รับผลกลับเป็นวัตถุ (วัตถุ JSON หรือใน Perl, พองขึ้นกับวัตถุผลเต็ม) ปัญหานี้ง่ายการประมวลผลข้อมูลบางอย่างที่ซับซ้อนและการจัดการกับร่วมด้านนอกและคอลเลกชัน.
• ตารางในตัวเครื่อง:
• ขณะนี้คุณสามารถฝังกำเนิดตารางข้อมูลจากเหมืองใด ๆ กับเว็บเซอร์ที่สนับสนุนการเข้าสู่หน้าเว็บของคุณด้วย JavaScript และ CSS ดูกวดวิชา Imbedding สำหรับการสาธิตและแนะนำให้รู้จักกับเทคนิคนี้ ให้แน่ใจว่าได้เล่นรอบกับห้องสมุด JavaScript ใหม่ที่สามารถใช้ได้ที่ http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Registry:
• เราได้เปิดตัวบริการการลงทะเบียนกลางสำหรับการใช้งาน InterMine นี้จะไม่เพียง แต่ทำหน้าที่เป็น & quot; เหลืองหน้า & quot ;, ทำให้ผู้เข้าชมที่จะค้นพบข้อมูลแหล่งที่มาใหม่และอำนวยความสะดวกในการทำงานร่วมกันระหว่างการทำเหมืองแร่ตัวเอง แต่ก็ยังสนับสนุน WebServices โดยการให้รีจิสทรีของ URL ของเว็บเซอร์และรุ่น เยี่ยมชมรีจิสทรีที่ http://www.intermine.org/registry และสำหรับความช่วยเหลือในการลงทะเบียนเหมืองของคุณเองเยี่ยมชม RegisteringYourMine.
• เปลี่ยนเส้นทางการเชื่อมโยง:
• คุณสามารถเพิ่มคุณสมบัติที่จะมีการเชื่อมโยงในหน้าผลลัพธ์การเปลี่ยนเส้นทางไปยัง URL ใด ๆ ดู LinkRedirects สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม.
• เนื้อหาของหน้าเว็บหน้าแรก:
• หน้าแรกสำหรับ InterMine ตอนนี้สามารถกำหนดค่าให้แสดงข้อมูลที่แตกต่างกันขึ้นอยู่กับว่าหรือไม่ผู้ใช้ใหม่ ดู HomepageConfig สำหรับคำแนะนำเกี่ยวกับวิธีการกำหนดค่าการทำงานนี้.
• แท็กใหม่:
• เราได้เพิ่มแท็กใหม่: im: admin ถ้าคุณแท็กแม่แบบ im: ผู้ดูแลระบบก็จะไม่แสดงขึ้นมาใน webapp ของคุณ นี้จะเป็นประโยชน์ในการซ่อนแม่จำเป็นโดย WebServices InterMine จากผู้ใช้ของคุณ ดูการติดแท็กสำหรับรายการของแท็กที่มีอยู่ทั้งหมด.
• อัพโหลด List:
• กระบวนการอัปโหลดรายชื่อที่ได้รับการปรับปรุงให้ดีขึ้น.
• การเปลี่ยนแปลงอื่น ๆ :
• UPDATE - แก้ไขการทดสอบสมมติฐานหลายอย่างเข้มงวดมากขึ้นในการตกแต่งเครื่องมือ & quot; จำนวนของการทดสอบ & quot; ขณะนี้จำนวนของข้อตกลงที่เกี่ยวข้องกับรายการการอ้างอิง.
• UPDATE - ตัวเลือกตัวกรองที่เป็นประโยชน์เพิ่มเติมเกี่ยวกับเครื่องมือการตกแต่ง
• ใหม่ - ตัวเลือกเกาะ-Bonferroni เพิ่มไปยังเครื่องมือการตกแต่ง
• UPDATE - ใหม่ & quot; ลบ & quot; ปุ่มในรายการหน้า
• UPDATE - ปฏิสัมพันธ์ Displayer โหลดผ่าน AJAX เพื่อรายงานการโหลดหน้าเว็บได้เร็วขึ้น
• การแก้ไข - & quot; คะแนน & quot; ภาพที่แสดงอย่างถูกต้องในผลการค้นหา
• UPDATE - QueryBuilder โต้ตอบมากขึ้นการเลือกรายการในรายการที่จะพาคุณกลับไปที่รายการเดิมหลังหน้าการฟื้นฟู / โหลด
• UPDATE - การเชื่อมโยงเข้ามาอยู่ในคอลัมน์สรุปในผลการค้นหาทำจะง่ายต่อการดูค่าที่แตกต่างกัน
• การแก้ไข - ข้อผิดพลาดเกี่ยวกับการเข้าสู่ระบบชื่อผู้ใช้ผสมกรณี
• การแก้ไข - ข้อผิดพลาดเครื่องมือเมื่อดูหลังจากที่การส่งออกข้อมูลเครื่องมือ
• ใหม่ - คำสั่งแม่แบบจะได้รับคำสั่งตามความนิยมเว้นแต่คุณจะถูกบันทึกไว้ในซึ่งในกรณีที่พวกเขาจะได้รับคำสั่งจากวันแต่ละแบบสอบถามวิ่งผ่านมา
• การแก้ไข - ข้อมูลไม่ซ้ำใน & quot; เบ็ดเตล็ด & quot; ส่วนในหน้ารายงาน
• การแก้ไข - แม่แบบแสดงอย่างถูกต้องในหน้ารายงานแม้ subclasses
• การแก้ไข - แม่แบบการแสดงผลได้อย่างถูกต้องบนหน้าเว็บด้าน
• UPDATE - ปรับปรุงแปลง BioGRID ที่จะรับมือกับการเปลี่ยนแปลงในแฟ้มข้อมูลใหม่ล่าสุด
• การแก้ไข - ต่างๆ & quot; ทอง & quot; CSS รูปแบบและภาพที่ดีขึ้นและการปรับปรุง
• การแก้ไข - ปัญหาความปลอดภัยหัวข้อ addressed ในแม่แบบการติดตาม
• UPDATE - เครื่องมือตารางสามารถจัดกลุ่มโดยคุณลักษณะเช่นเดียวกับชั้น

ต้องการ

• หลาม