MacMolPlt เป็นเครื่องมือสร้างภาพเคมีที่สามารถนำมาใช้ในการสร้างโมเลกุลที่มีรูปแบบการสร้างกราฟิกแบบบูรณาการสร้างไฟล์ข้อมูลสำหรับโปรแกรมการคำนวณเคมี GAMESS แล้วเห็นภาพผลของการวิ่งการคำนวณเคมี รวมถึงที่มีคุณภาพสูงการแสดงผล 3 มิติ, ภาพเคลื่อนไหวของโหมดปกติและลำดับการเกิดปฏิกิริยาและการส่งออกที่หลากหลายของรูปแบบรวมทั้งภาพที่มีคุณภาพสูงและ QuickTime และ Flash ภาพยนตร์
- ใส่ใช้:
- รูปแบบไฟล์ MolPlt ออกมาเจาะโดย GAMESS
- โดยวางในพิกัดคาร์ทีเซียนจาก GAMESS หรือเสียน log file
- ป้อนข้อมูลใด ๆ GAMESS เข้าสู่ระบบหรือแฟ้ม IRC
- Xmol ไฟล์ XYZ สไตล์
- Molden ไฟล์รูปแบบ
- โปรตีนข้อมูลธนาคาร (PDB ) ยื่น
- เคมี Markup Language (CML) ไฟล์
- สร้างกราฟิกกับบรรณาธิการโมเลกุลโต้ตอบ
- สร้างด้วยมือโดยใช้รูปแบบคาร์ทีเซียนหรือ Z-Matrix พิกัดภายใน
- การแสดงผล 3 มิติของโครงสร้างและโหมดปกติ
- นิเมชั่นของโหมดปกติ.
- 3D หมุนเรียลไทม์และการแปลภายใต้การควบคุมเมาส์
- การคำนวณใด ๆ Z-เมทริกซ์พารามิเตอร์
- วัดสายตา / ระยะทางที่แสดงมุมและ dihedrals.
- สร้างอัตโนมัติของการเคลื่อนไหวเชิงเส้นน้อย (LLM) เส้นทาง
- 2D และการคำนวณ 3D และการแสดง:
- orbitals โมเลกุล (AO ของ MO หรือ LMO ของ)
- รวมความหนาแน่นของอิเล็กตรอน
- ความแตกต่างของความหนาแน่น
- โมเลกุลไฟฟ้าสถิตศักยภาพ (MEPMaps)
- เครื่องกำเนิดไฟฟ้าแฟ้มข้อมูลพื้นฐานสำหรับการ GAMESS
- OpenGL ที่ใช้สำหรับการแสดงผลที่มีคุณภาพสูง 3D
- การสนับสนุนสำหรับสมมาตรโมเลกุล
- สร้างสมมาตรอะตอมขึ้น
- กำหนดสมมาตรอะตอมที่ไม่ซ้ำกัน
- โดยอัตโนมัติตรวจสอบรายชื่อของกลุ่มจุดสนับสนุนสำหรับชุดของพิกัด
- หมุนพิกัดลงในการวางหลักการที่เหมาะสม
- ผู้ประกอบการสมมาตรแสดงผลสำหรับกลุ่มหลายจุด
- ผลผลิตที่มีคุณภาพที่ตีพิมพ์ (สีหรือขาวดำ) ผ่านทาง พิมพ์โดยตรงหรือคัดลอกและวางลงในโปรแกรมประยุกต์อื่น.
- เอาท์พุทในหลากหลายรูปแบบรวมทั้งบิตแมปของ Windows, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, แฟลชภาพยนตร์และภาพยนตร์ QuickTime.
มีอะไรใหม่ ในข่าวประชาสัมพันธ์นี้:
การปรับปรุงหลายคนได้รับการทำรหัสการแสดงผล ตัวเลือกได้รับการเพิ่มบานหน้าต่าง 3 มิติของ prefernces สำหรับแรเงาเรียบที่มีและไม่มีเงา
เพิ่มการสนับสนุนพื้นฐานสำหรับไฟล์ Mopac
เพิ่มตัวเลือกเพื่อสลับการแสดงผลของเริ่มแรก, MM และอะตอม EFP
การสนับสนุนที่ดีขึ้นสำหรับรุ่นแกนศักยภาพ
เพิ่มเบ็ดในการสร้างการป้อนข้อมูลสำหรับโปรแกรม GAMESSQ ใหม่
การปรับปรุงตัวแยกวิเคราะห์ไฟล์ PDB.
ความคิดเห็นที่ไม่พบ