SeedWaterSegmenter เป็นเครื่องมือหลามกราฟิกเพื่อโต้ตอบส่วนกองภาพของเซลล์ในเนื้อเยื่อที่มีขอบป้าย & nbsp (aka โครงร่างสีขาว.). ปฏิสัมพันธ์จะขึ้นอยู่กับการแก้ไขของเมล็ดซึ่งจะมีการขยายตัวสันปันน้ำ ขั้นตอนวิธี ความแตกต่างที่สำคัญระหว่าง SWS และเครื่องมืออื่น ๆ ที่คุณสามารถวางมากกว่าหนึ่งเมล็ดต่อเซลล์ซึ่งสามารถช่วยให้คุณปรับขอบเขตของเซลล์ที่ยากลำบาก
SWS ถูกสร้างขึ้นที่ด้านบนของ wxPython, matplotlib, numpy, scipy และ Mahotas
ที่เป็นแกนหลักของมันก็ใช้วิธีลุ่มน้ำได้อย่างรวดเร็ว (ขอบคุณโครงการ Mahotas) และช่วยให้การปรับปรุงเวลาจริง มันมีง่าย (ถ้ารก) UI และมีการโต้ตอบอย่างเต็มที่แม้รวมทั้งยกเลิก 1 ระดับ
สิ่งพิมพ์เกี่ยวกับ SWS ที่ให้รายละเอียดทั้งหมดเหล่านี้และอื่น ๆ ในส่วนที่ Cytometry:
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cyto.a.22034/abstract
รหัสที่มาสะท้อนถึงสี่เก็บและ PyPI:
- GitHub: http://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/
- Bitbucket: http://bitbucket.org/davidmashburn/seedwatersegmenter
- Gitorious: http://gitorious.org/seedwatersegmenter
- รหัส Google: http://code.google.com/p/seedwater/
- PyPI: http://pypi.python.org/pypi/SeedWaterSegmenter
หน้ารหัส Google ยังมีบางรุ่นไบนารี (http://code.google.com/p/seedwater/) ที่ควรจะทำงานบน Linux Windows 32 บิตหรือ 64 บิต แต่เหล่านี้ตอนนี้เก่า กรุณาใช้ "easy_install" วิธีการในขณะนี้
สำหรับรายละเอียดเพิ่มเติมโปรดดูคำแนะนำในการติดตั้งหลาม 20XX.txt คุณอาจต้องการที่จะอ่านคู่มือ: SeedWater Segmenter V xx Manual.txt
การติดตั้งและการใช้งาน
การติดตั้งเป็นเรื่องง่ายที่สุด!
ในความเป็นจริงคุณสามารถตอนนี้ "easy_install SeedWaterSegmenter"
คำแนะนำด่วน:
ของ Windows / Mac:
& nbsp; ติดตั้งกระจาย Enthought หลาม http://www.enthought.com/products/edudownload.php
อูบุนตู / Debian:
& nbsp; sudo apt-get install หลาม setuptools หลาม wxtools หลาม numpy หลาม scipy หลามหลาม matplotlib ถ่ายภาพหลาม xlrd หลาม xlwt
ในหน้าต่าง cmd (ต้องเรียกใช้ในฐานะผู้ดูแลภายใต้ Windows Vista / 7) หรือเทอร์ (Mac / Linux) ทำงาน:
& nbsp; easy_install Mahotas cmpGen EllipseFitter FilenameSort GifTiffLoader ImageContour SeedWaterSegmenter
คำแนะนำโดยละเอียด:
รุ่นล่าสุดที่เรียกว่า:
"งูใหญ่ติดตั้งคำแนะนำสิงหาคม 2012.txt"
https://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/blob/master/Python ติดตั้งคำแนะนำสิงหาคม 2012.txt
ต้องการ
- < li> หลาม
ความคิดเห็นที่ไม่พบ