Spindel เป็นวิธีทางเลือกสำหรับการระบุทางชีวภาพขึ้นอยู่กับความยาวของไรโบโซม RNA (rRNA) ภูมิภาคยีน โดยทั่วไปการจัดแนวของลำดับยีน rRNA หลักจากสายพันธุ์ที่แตกต่างกันแสดงภูมิภาคสลับเบื่อหน่ายของการอนุรักษ์และการเปลี่ยนแปลงทั้งในแง่ของการแทนเบื่อหน่าย (เรียกกันว่า "นิป") และแทรก / ลบ (Indel) เหตุการณ์ที่เกิดขึ้น การปรากฏตัวของผลการ indels ในลำดับของความยาวที่แตกต่างกันและแนะนำช่องว่างในการจัดตำแหน่งที่แสดงโดยทั่วไปขีด "-"
แนวความคิดของเราสำหรับการระบุทางชีวภาพใช้ rRNA ลำดับยีนดังนี้ภูมิภาคอนุรักษ์ที่ใช้ในการกำหนดกลุ่มตัวแปร ("hypervariable ภูมิภาค Spindel") ซึ่งในการรวมกันของลำดับความยาวเป็นลักษณะของแต่ละสายพันธุ์ ("รายละเอียด Spindel") ดังนั้นแต่ละชนิดสามารถกำหนดได้โดยรายละเอียดที่เป็นตัวเลขที่ไม่ซ้ำกัน
ในทางทฤษฎีการสำรวจเพียง 6 ภูมิภาค hypervariable 20 อัลลีลแต่ละ (หรือ 11 พื้นที่ที่มี 5 อัลลีลในแต่ละ) ก็เพียงพอที่จะแยกแยะสายพันธุ์ยูคาริโอบนโลกซึ่งคาดว่าจะอยู่ระหว่าง 5 และ 15 ล้านบาทในจำนวน ในทางปฏิบัติ Spindel สามารถที่จะเลือกปฏิบัติ 93.3% ของสายพันธุ์ยูคาริโอที่มีการเปลี่ยนแปลงสำนวนต่ำและความละเอียดสูงสายวิวัฒนาการ
ความคิดเห็นที่ไม่พบ