Ghemical เป็นแพคเกจซอฟต์แวร์คำนวณเคมีออกภายใต้ GNU GPL ก็หมายความว่ารหัสที่มาเต็มรูปแบบของแพคเกจที่มีอยู่และผู้ใช้มีอิสระในการศึกษาและปรับเปลี่ยนแพคเกจ Ghemical เขียนใน C ++
โครงการ Ghemical มีอินเตอร์เฟซผู้ใช้แบบกราฟิก (ซึ่งจะขึ้นอยู่กับ GNOME) และสนับสนุนทั้งกลศาสตร์ควอนตัม (กึ่งเชิงประจักษ์และเริ่มแรก) รูปแบบและรูปแบบกลศาสตร์โมเลกุล (มีแปลงทดลอง Tripos แรง 5.2 เหมือนสำหรับ molecu อินทรีย์นอกจากนี้ เครื่องมือสำหรับรุ่นโปรตีนลดลง [1] จะรวม. การเพิ่มประสิทธิภาพเรขาคณิตการเปลี่ยนแปลงโมเลกุลและชุดใหญ่ของเครื่องมือสร้างภาพมีอยู่ในปัจจุบัน
Ghemical อาศัยรหัสภายนอกเพื่อให้การคำนวณกลควอนตัม วิธีกึ่งเชิงประจักษ์ MNDO, Mindo / 3, AM1 และ PM3 มาจากแพคเกจ MOPAC7 (โดเมนสาธารณะ) และรวมอยู่ในการกระจายแหล่งที่มา
แพคเกจ MPQC (GNU GPL) ถูกนำมาใช้เพื่อให้เริ่มแรกวิธีการ: วิธีการขึ้นอยู่กับ Hartree-Fock ทฤษฎีได้รับการสนับสนุนในขณะนี้ชุดพื้นฐานตั้งแต่ STO-3G ที่จะ 6-31G **
รหัส MPQC ไม่ได้รวมอยู่ในการกระจายแหล่งที่มา เพื่อที่จะใช้ AB MPQC เริ่มแรกที่ใช้วิธีการในการ Ghemical คุณต้องรวบรวมและติดตั้งโปรแกรม MPQC สำหรับระบบของคุณและจากนั้นรวบรวม Ghemical ใช้การตั้งค่าบางอย่างที่เชื่อมโยงโปรแกรมด้วยกัน ดูไฟล์ติดตั้งสำหรับข้อมูลเพิ่มเติม Ghemical ยังมีแพคเกจ OpenBabel สำหรับการนำเข้าและการส่งออกในรูปแบบไฟล์ที่แตกต่างกัน (เช่นเดียวกับงานอื่น ๆ )
การติดตั้ง
เมื่อคุณดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดที่คุณควรดึงไฟล์ทั้งหมดจากไฟล์ที่เก็บถาวรของคุณโดยใช้ "tar -zxvvf ghemical-1.00.tgz" หรือเท่ากัน "gunzip ghemical-1.00.tgz; tar -xvvf ghemical-1.00.tar" หลังจากนั้นโปรดอ่าน "ติดตั้ง" แฟ้ม: คุณเพียงแค่สกัดที่จะได้รับข้อมูลเพิ่มเติม
มีอะไรใหม่ในรุ่นนี้:
ความคิดเห็นที่ไม่พบ