รายละเอียดซอฟแวร์:
MISO (ส่วนผสมของไอโซฟอร์ม) เป็นกรอบความน่าจะเขียนในหลามที่ quantitates ระดับการแสดงออก & nbsp; ของยีนแต่งงานหรือจากข้อมูล RNA-Seq และระบุไอโซฟอร์มการควบคุมที่แตกต่างกันหรือ exons ทั่วตัวอย่าง
โดยการสร้างแบบจำลองกระบวนการกำเนิดโดยที่อ่านผลิตจากไอโซฟอร์มใน RNA-Seq รุ่น MISO ใช้การอนุมานแบบเบย์ในการคำนวณความน่าจะเป็นที่อ่านมาจากไอโซฟอร์มโดยเฉพาะอย่างยิ่ง
MISO ใช้การกำหนดสรุปของการอ่านให้กับไอโซฟอร์มการ quantitate ปริมาณของชุดพื้นฐานของไอโซฟอร์ม mRNA ทางเลือก ช่วงความเชื่อมั่นกว่าประมาณการสามารถรับได้ซึ่งปริมาณความน่าเชื่อถือของประมาณการ
โปรดดู http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ คู่มือ MISO และเอกสาร
ต้องการ .
- หลาม
ความคิดเห็นที่ไม่พบ