mpiBLAST เป็น MPI ตามการดำเนินการคู่ขนานของ NCBI ระเบิด โครงการประกอบด้วยคู่ของโปรแกรมที่เข้ามาแทนที่และ formatdb blastall กับรุ่นที่ดำเนินงานระเบิดในแบบคู่ขนานในกลุ่มของเครื่องคอมพิวเตอร์ที่มีการติดตั้ง MPI มีสองข้อได้เปรียบหลักในการใช้ mpiBLAST เมื่อเทียบกับระเบิดแบบดั้งเดิม
ครั้งแรก mpiBLAST แยกฐานข้อมูลทั่วแต่ละโหนดในคลัสเตอร์ เพราะส่วนของแต่ละโหนดของฐานข้อมูลมีขนาดเล็กก็มักจะสามารถอยู่ในบัฟเฟอร์แคชผลผลิตเพิ่มความเร็วอย่างมีนัยสำคัญเนื่องจากการกำจัดของดิสก์ I / O ประการที่สองจะช่วยให้ผู้ใช้ระเบิดที่จะใช้ประโยชน์จากการที่มีประสิทธิภาพต้นทุนต่ำกลุ่ม Beowulf เพราะความต้องการ interprocessor การสื่อสารอยู่ในระดับต่ำ
mpiBLAST ประสบความสำเร็จในการเร่งความเร็วซุปเปอร์เชิงเส้นในสถานการณ์ที่ฐานข้อมูลที่มีขนาดใหญ่เกินไปที่จะพอดีกับ RAM, และเพิ่มความเร็วใกล้เชิงเส้นในสถานการณ์อื่น ๆ มันไม่จำเป็นต้องเป็นกลุ่มเฉพาะ
ต้องการ:
ความคิดเห็นที่ไม่พบ