ZOOM Lite เป็นลำดับรุ่นต่อไปการทำแผนที่ข้อมูลและซอฟต์แวร์การสร้างภาพ ผู้ใช้ป้อนข้อมูลจีโนมของการอ้างอิงและ Illumina / Solexa สั้นอ่านไฟล์หรือพื้นที่สี AB ของแข็งอ่านไฟล์ในรูปแบบต่างๆเช่น .fasta * * .fastq * _seq.txt * .csfasta ฯลฯ ZOOM ผลผลการทำแผนที่ของสั้นเหล่านี้ อ่านลำดับอ้างอิง ZOOM Lite มีเคอร์เนลแผนที่ได้อย่างรวดเร็วและถูกต้องขึ้นอยู่กับหลาย ๆ คนที่ออกแบบใหม่ระยะห่างทฤษฎีเมล็ด ทั้งเดี่ยวและคู่สิ้นสุดสิ้นอ่านของความยาวต่างๆจาก 15bp 240bp จะสามารถจัดการได้ จำนวนใด ๆ ที่ไม่ตรงกันและเป็นหนึ่งในการแทรก / ลบความยาวต่างๆระหว่างการอ่านและพื้นที่เป้าหมายที่มีต่อลำดับการอ้างอิงที่ได้รับอนุญาต ผลการแมปไม่ซ้ำกันหรือดีที่สุด (บน N) ผลสำหรับการอ่านแต่ละคนจะมีการรายงานตามที่ไม่ตรงกันและระยะเวลาที่น้อยที่สุด Indel คะแนนคุณภาพถูกนำมาใช้เพื่อเพิ่มความแม่นยำในการทำแผนที่ ขึ้นอยู่กับการทำแผนที่เคอร์เนล, ZOOM Lite ช่วยให้ผู้ใช้สามารถโหลดข้อมูลการอ่านท้องถิ่นและข้อมูลลำดับการอ้างอิงเลือกพารามิเตอร์ที่เหมาะสมประมวลผลข้อมูลที่มีปริมาณสูงในแบบคู่ขนานในหมู่ถึงสี่ซีพียูตรวจสอบงานที่ทำงานเก็บผลการทำแผนที่ดูกราฟของ ผลการทำแผนที่และผลการทำแผนที่การส่งออกทั้งใน * * * * * * * * .BED หรือรูปแบบไฟล์ .GFF ต่อการสำรวจที่มีข้อมูลการติดตาม UCSC เบราว์เซอร์ ผลการจัดทำแผนที่สามารถดูได้ในระดับที่ต้องการใด ๆ จากกราฟความลึกอ่านมากกว่าโครโมโซมทั้งหมดเพื่อจัดแนวลำดับรายละเอียดระหว่างอ่านและลำดับการอ้างอิง ผู้ใช้สามารถนำทางไปยังภูมิภาคที่น่าสนใจเพียงแค่ผ่านการคลิกและลากหรือเลื่อน ZOOM Lite เป็นที่มาของซอฟแวร์สตูดิโอ ZOOM
มีอะไรใหม่ ในข่าวประชาสัมพันธ์ฉบับนี้.
รุ่น 1.5 รวมถึงรูปแบบการส่งออก SAM สถาปัตยกรรมปรับเพิ่มประสิทธิภาพของโค้ดที่ดีกว่าที่มีขนาดเล็ก โปรแกรมขนาดไบนารีและ engining dabase อัพเกรดสำหรับประสิทธิภาพที่ดีขึ้น.
ความคิดเห็นที่ไม่พบ