PathVisio เป็นโอเพนซอร์สและการประยุกต์ใช้แบบกราฟิกสมบูรณ์ฟรีนำมาใช้ในการเขียนโปรแกรมภาษา Java และการออกแบบจากพื้นดินขึ้นเพื่อนำมาใช้สำหรับการแสดง, การวิเคราะห์และการแก้ไขทางเดินทางชีวภาพภายใต้การดำเนินงาน GNU / Linux system.Can ถูกนำมาใช้ในการวาดทุลักทุเล เชื่อมโยงซอฟต์แวร์ entitiesThe ชีวภาพช่วยให้ผู้ใช้ในการวาดเส้นทางการเชื่อมโยงหน่วยงานทางชีวภาพ (โปรตีนหรือยีน) ข้อมูลทางชีวภาพโดยใช้ตัวระบุฐานข้อมูล, แก้ไขทางเดินเช่นเดียวกับการวิเคราะห์ทางเดิน ด้วย PathVisio คุณยังจะสามารถที่จะ map ข้อมูลการทดลองเช่นข้อมูล microarray, และเห็นภาพไว้ที่ด้านบนของการวาดภาพทางเดินที่มีอยู่
นอกจากนี้คุณจะสามารถที่จะเลือกฐานข้อมูลของยีนเลือกฐานข้อมูลการเผาผลาญดูสถิตินำเข้าข้อมูลการแสดงออกเลือกชุดการแสดงออกทางเดินค้นหาตำนานมุมมองจัดการวัตถุโครงการนำเข้าเช่นเดียวกับการติดตั้งและการจัดการปลั๊กอิน ซึ่งสามารถเพิ่มฟังก์ชันการทำงานเพิ่มเติมเพื่อการประยุกต์ใช้ app.Requires installationThe ไม่สามารถใช้งานได้โดยไม่ต้องติดตั้งบนระบบปฏิบัติการ GNU / Linux ของคุณ สิ่งที่คุณต้องทำคือการดาวน์โหลดแพคเกจไบนารีจาก Softoware บันทึกเก็บสถานที่ตั้งของทางเลือกของคุณแยกได้โดยใช้ยูทิลิตี้ผู้จัดการเก็บ, เปิดไดเรกทอรีสกัดและดับเบิลคลิกที่ pathvisio.jar file.Under hoodWhile การดูอย่างรวดเร็วภายใต้ประทุนของซอฟต์แวร์ PathVisio เรา rsquo; ve สังเกตเห็นว่าโปรแกรมจะเขียนทั้งหมดในการเขียนโปรแกรมภาษา Java และที่อินเตอร์เฟซผู้ใช้แบบกราฟิกของมันได้รับการออกแบบด้วยเทคโนโลยีล่าสุด Java Swing เรา rsquo; และประสบความสำเร็จในการทดสอบโปรแกรมประยุกต์บนคอมพิวเตอร์สนับสนุนทั้ง 32 หรือ 64 บิต architectures.Runs ของ CPU บนระบบปฏิบัติการใด ๆ ที่ Java เป็น supportedBeing เขียนในการเขียนโปรแกรมภาษา Java, PathVisio สามารถประกาศการประยุกต์ใช้แพลตฟอร์มที่สนับสนุน GNU / Linux ไมโครซอฟท์ Windows, Mac OS X, BSD, Solaris, และระบบปฏิบัติการอื่น ๆ ที่เทคโนโลยีล่าสุด Java ได้รับการสนับสนุน
มีอะไรใหม่ ในข่าวประชาสัมพันธ์ฉบับนี้.
- 31 มกราคม 2014: รุ่นที่แก้ไขข้อผิดพลาด
- แง่ GeneOntology จะถูกลบออกในขณะนี้จากผลการค้นหาสำหรับคำอธิบายประกอบ
- DataNodes จะต้องมีข้อเขียนที่มี ID และแหล่งข้อมูลหรือไม่มีอะไร (ประหยัดโหนดข้อมูลที่มีรหัสเฉพาะหรือแหล่งข้อมูลไม่ได้รับอนุญาตอีกต่อไป)
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 3.1.2:
- ข้อผิดพลาดที่สำคัญในโมดูลนำเข้าไฟล์คงที่: http: //developers.pathvisio.org/ticket/1697
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.0.11:
- บันทึกอัตโนมัติ
- ซูมโดยใช้ล้อเลื่อน
- เลือกของสายเป็นเรื่องง่าย: ไม่จำเป็นต้องคลิกที่พิกเซลที่แน่นอน
- ขณะนี้มีสองวิธีในการวิเคราะห์มากกว่าการเป็นตัวแทน; หนึ่งทางเดินที่มุ่งเน้นและเป็นหนึ่งในข้อมูลที่มุ่งเน้น
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.0.10:
- วิธีใหม่ของการวาดภาพสี่เหลี่ยมโค้งมนเพื่อหลีกเลี่ยงผลกระทบยืด
- เล็ก ๆ น้อย ๆ สิ่งที่ต้อง
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.0.9:
- ประเภทการเชื่อมต่อใหม่สำหรับการเชื่อมต่อของความยาวโดยพลการและตามอำเภอใจ มุม
- ใหม่ & quot; องค์ประกอบโทรศัพท์มือถือ & quot; สถานที่ให้บริการสำหรับการจัดเก็บความหมายทางชีวภาพของช่อง
- ใหม่ & quot; คู่ & quot; ชนิดสาย (มีประโยชน์โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับ organelles สอง membraned)
- คลิกได้เชื่อมโยงหลายมิติในทางเดิน
- ดูก้าว: & quot; milestone_27 & quot; สำหรับรายการที่สมบูรณ์ของการแก้ไขข้อบกพร่อง
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.0.8:
- รูปร่างที่ดีขึ้นสำหรับส่วนประกอบของเซลล์
- ปรับปรุงการใช้งานบางอย่างเช่นคัดลอก / วางในเมนูป๊อปอัพ
- ดูก้าว: & quot; milestone_26 & quot; สำหรับรายการที่สมบูรณ์ของการแก้ไขข้อบกพร่อง
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.0.7:
- ไอคอนแถบเครื่องมือและแผงด้านข้างใหม่ที่จะทำให้มันง่ายขึ้น เพื่อเลือกประเภทลูกศรและรูปทรง (liubing ขอบคุณ)
- ฐานข้อมูลเส้นทางที่จะถูกรวมเป็นแหล่งข้อมูลเพื่อให้คุณสามารถเพิ่มการเชื่อมโยงจากที่หนึ่งไปยังอีกทางเดิน
- BioPAX แปลงได้รับการปรับปรุงและผลิตเอกสารที่ถูกต้องมากขึ้น BioPAX.
- ประเภทการเชื่อมต่อใหม่ที่แต่ละจุดสามารถจัดการ (leonth ขอบคุณ)
- จำนวนแหล่งข้อมูลที่ได้รับเพิ่มขึ้นถึงกว่า 180
- ดูก้าว: & quot; milestone_25 & quot; สำหรับรายการที่สมบูรณ์ของการแก้ไขข้อบกพร่อง
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.0.6:
- จำนวนของแองเคอกับรูปร่างสามารถเพิ่มขึ้น จากเริ่มต้น 12.
- ตำนานของการแสดงข้อมูลขณะนี้สามารถแสดงให้เห็นถึงภาพทางเดินของตัวเอง ก่อนหน้านี้มันก็เป็นเพียงมองเห็นได้ในแผงด้านข้าง.
- ดูก้าว: & quot; milestone_24 & quot; สำหรับรายการที่สมบูรณ์ของการแก้ไขข้อบกพร่อง
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.0.4:
- จัดรูปแบบข้อความที่ดีขึ้นของรูปทรงฉลากและ datanodes
- รูปทรงอื่น ๆ อีกมากมายสำหรับ datanodes
- พิกัดพิกเซลง่าย
- สีพื้นหลังตั้งอยู่บน datanodes
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.0.3:
- น่าสังเกตมากที่สุดในรุ่นนี้คือแบบแผน XML ใหม่ สำหรับรูปแบบทางเดิน GPML (รุ่น 2010a) รูปแบบนี้ทางเดินใหม่จะช่วยให้ความสามารถของกราฟิกใหม่ ๆ ในอนาคตคุณสามารถมองไปข้างหน้าเพื่อบางส่วนของผู้ที่ปรากฏในรุ่นถัดไป.
- อื่น ๆ คุณสมบัติใหม่:
- เบรกที่มองไม่เห็นจะมองไม่เห็นจริงๆอย่างน้อยเมื่อบางสิ่งบางอย่างที่เชื่อมต่อกับพวกเขา (ขอขอบคุณมาร์กอท)
- ตัวเลือกเสริมบรรทัดคำสั่ง -v (ขอบคุณมาร์ค)
- ฐานข้อมูลที่เลือกในปัจจุบันแสดงอย่างถูกต้องในแถบสถานะอีกครั้ง
- จุดส่วนขยายใหม่จำนวนมากสำหรับนักพัฒนาปลั๊กอิน
- ดูก้าว: & quot; milestone_21 & quot; สำหรับรายการที่สมบูรณ์ของการแก้ไขข้อบกพร่อง
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 2.0.1:
- อัลกอริทึมที่ดีขึ้นสำหรับตัวเชื่อมต่ออัตโนมัติที่ชี้ไปยังผู้ประกาศข่าว .
- การวาดภาพที่ดีขึ้นของประเภทลูกศรที่มีระยะสั้น & quot; ช่องว่าง & quot; ในตอนท้าย.
- เพราะบริการ Thawte FreeMail ได้ถูกยกเลิกเราปรับปรุงการรักษาความปลอดภัยของเรารับรอง
- โปรแกรมดูประวัติ Pathway มีข้อผิดพลาดที่แต่ละบรรทัดได้รับการพิจารณาปรับเปลี่ยนถึงแม้ว่ามันจะไม่ได้ นี้ได้รับการแก้ไข.
ต้องการ
- ของ Oracle Java Standard Edition Runtime Environment
ความคิดเห็นที่ไม่พบ