ระบบ E-Cell เป็นแนวคิดของการสร้างเซลล์เสมือนบนคอมพิวเตอร์
ระบบ E-Cell เป็นชุดซอฟต์แวร์เชิงวัตถุสำหรับการสร้างแบบจำลองการจำลองและการวิเคราะห์ของระบบที่ซับซ้อนขนาดใหญ่เช่นเซลล์ชีวภาพออกแบบโดย Kouichi ทากาฮาชิและเขียนโดยทีมงานที่ยอดเยี่ยมของนักพัฒนา ส่วนหลักของระบบ E-Cell จำลองสิ่งแวดล้อมรุ่นที่ 3 ช่วยให้หลายส่วนประกอบที่ผลักดันโดยขั้นตอนวิธีการหลายรายที่มีระยะเวลาที่แตกต่างกันในการอยู่ร่วมกัน
โครงการ E-Cell เป็นโครงการวิจัยระหว่างประเทศเป้าหมายในการพัฒนาสนับสนุนทฤษฎีที่จำเป็นเทคโนโลยีและแพลตฟอร์มซอฟต์แวร์เพื่อช่วยให้การจำลองเซลล์ได้อย่างแม่นยำทั้ง
ระบบ E-Cell ประกอบด้วยดังต่อไปนี้สามส่วนหลัก:
- E-Cell จำลองสิ่งแวดล้อม (หรือ E-Cell SE)
- E-Cell การสร้างแบบจำลองสิ่งแวดล้อม (หรือ E-โทรศัพท์มือ ME)
- E-Cell การวิเคราะห์เครื่องมือ
คุณสมบัติ
- ความสามารถพื้นฐาน:
- การสร้างแบบจำลองเชิงวัตถุและการจำลองของระบบที่ซับซ้อน.
- สถาปัตยกรรม Plug-in เรียนผู้ใช้วัตถุใหม่สามารถพัฒนาโหลดแบบไดนามิกและใช้ในการจำลอง.
- โต้ตอบกับผู้ใช้เรียลไทม์และการมองเห็นระหว่างการจำลอง.
- การเขียนสคริปต์:
- สคริปต์หลามของเซสชั่นจำลอง (วิ่ง / หยุด / จัดการพารามิเตอร์ / ประมวลผลข้อมูล ฯลฯ ... ).
- สคริปต์หลามของการทดลองจำลองที่เกี่ยวข้องกับการทำงานของการประชุมหลายจำลอง (เช่นการปรับแต่งพารามิเตอร์การวิเคราะห์การควบคุมการเผาผลาญอาหาร ฯลฯ .. )
- สคริปต์หลามของการสร้างแฟ้มรูปแบบ (เช่นการก่อสร้างรูปแบบโดยอัตโนมัติจากฐานข้อมูล).
- การใช้งาน:
- SBML ระดับ 1/2 การนำเข้า.
- ระดับ SBML 1/2 ส่งออก.
- การคำนวณแบบขนาน:
- หน่วยความจำที่ใช้ร่วมกันแบบขนานด้ายหลายของเซสชั่นจำลองเดียว (ที่จะรวมเข้าเป็นสาขาหลัก.)
- คลัสเตอร์และตารางการคำนวณการกระจายของการประชุมจำลองหลาย ๆ อาทิตย์กริดเครื่องยนต์ (เครื่องมือลูกโลก).
มีอะไรใหม่ ในข่าวประชาสัมพันธ์ฉบับนี้.
- รุ่นนี้จะเพิ่ม bugfixes ต่างๆ
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 3.1.107 RC2:
- แก้ไขข้อผิดพลาดใน ecell.Session.saveLoggerData () (Moriyoshi)
- แก้ไขข้อผิดพลาดใน ecell.ECDDataFile (Moriyoshi)
มีอะไรใหม่ ในรุ่น 3.1.107 RC1:
- ปัญหาการสะสมคงที่ใน GCC ใหม่ (& gt; = 4.3) (Moriyoshi)
- pyecs แบบบูรณาการเข้าไปใน pyecell (Moriyoshi)
- ecell.emc ผสานเข้า ecell.ecs เพื่อหลีกเลี่ยงความแปลกประหลาด initializer คงที่ในแพลตฟอร์มบางคน (รวมถึง Mac OS X) (Moriyoshi)
- สอง frontends GUI (เซสชั่นการตรวจสอบและแก้ไขรูปแบบ) ได้รับการต่ออายุจะเป็นสองแพคเกจของโมดูลหลาม ecell.ui.osogo และ ecell.ui.model_editor (Moriyoshi)
- GtkSessionMonitor ย้ายไป ecell.ui.osogo.GtkSessionMonitor ที่อยู่ใน ecell / หน้า / session_manager (Moriyoshi)
- เปลี่ยนชื่อ ecell.SessionManager เพื่อ ecell.session_manager (Moriyoshi)
- ลบค่าคงที่ต่อไปนี้จาก ecell.ecs_constants (Moriyoshi)
ความคิดเห็นที่ไม่พบ