Pathomx (ก่อน MetaPath) เป็นโอเพนซอร์สซอฟต์แวร์กราฟิกดำเนินการใน IPython, Qt และ PyQt ได้รับการออกแบบจากพื้นดินขึ้นเพื่อทำหน้าที่เป็นยูทิลิตี้แบบโต้ตอบสำหรับการแสดงและการวิเคราะห์ข้อมูลการเผาผลาญอาหารภายใต้ GNU / Linux และ POSIX อื่น ๆ & nbsp; ปฏิบัติการ ระบบ มันถูกออกแบบในขั้นต้นที่จะใช้สำหรับการประมวลผล data.Features metabolomics ที่คุณสมบัติ glanceKey รวมถึงการสนับสนุนการนำเข้าและการส่งออก NMR (แม่เหล็กนิวเคลียร์) ข้อมูลการประมวลผลสเปกตรัมรวมทั้งการฟื้นฟู binning, และการจัดตำแหน่งเช่นเดียวกับการสร้างภาพทางเดินการเผาผลาญและการทำเหมืองแร่ นอกจากนี้คุณยังจะสามารถที่จะนำเข้าข้อมูลจีโนมและ metabolomics ผ่านเส้นทางต่างๆสำหรับการแสดงบนทางเดินที่ระบุ
คำอธิบายประกอบฐานข้อมูลต่างๆ MetaCyc จะรวมอยู่ในโปรแกรม Pathomx ในระหว่างที่เราสามารถพูดถึงการเชื่อมโยงการรวมฐานข้อมูลคำพ้องความหมายเช่นเดียวกับทางเดินที่เกี่ยวข้องและปฏิกิริยา โปรดทราบว่าฐานข้อมูล MetaCyc ได้มาจากประชาชน API
การประยุกต์ใช้ฐานข้อมูลที่มีประสิทธิภาพ MetaCyc สำหรับการสำรวจอย่างรวดเร็วของชุดข้อมูลที่ซับซ้อนขอบคุณขยายและปลั๊กอินที่กำหนด นอกจากนี้ยังใช้ Numpy และห้องสมุด scipy สำหรับการจัดการจำนวน Matplotlib สำหรับกราฟ nmrglue สำหรับการนำเข้าข้อมูล NMR, d3.js สำหรับกราฟโต้ตอบและ scikit การเรียนรู้สำหรับการวิเคราะห์ทางสถิติ methods.Under เครื่องดูดควันและได้รับการสนับสนุน OSesLooking ภายใต้ประทุนของ Pathomx เราสามารถแจ้งให้ทราบว่าโปรแกรมประยุกต์ที่ได้รับการสร้างขึ้นบนเปลือกคำสั่ง IPython นอกจากนี้ยังทำงานได้ดีภายใต้ระบบปฏิบัติการ Microsoft Windows และ Mac OS X ระบบปฏิบัติการที่มันสามารถใช้ได้สำหรับการดาวน์โหลดเป็น pre-built แพคเกจไบนารี สำหรับ GNU / Linux, ซอฟแวร์มีการกระจายเป็นเพียงแหล่งเก็บ gzipped เข้ากันได้กับ 32 บิตและแพลตฟอร์มฮาร์ดแวร์ 64 บิต
เมื่อใช้ Pathomx ผู้ใช้ควรเก็บไว้ในใจว่าโปรแกรมประยุกต์ที่ทำให้การใช้ข้อมูลจากฐานข้อมูลของทางเดิน MetaCyc ตัวเองซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของครอบครัว BioCyc API MetaCyc ถูกนำมาใช้ในการสร้างฐานข้อมูลที่ให้มาซึ่งถูกจัดเก็บไว้
มีอะไรใหม่ ในข่าวประชาสัมพันธ์ฉบับนี้.
- ใหม่ที่สมบูรณ์แบบลากวางโปรแกรมแก้ไขภาพถูกบันทึก.
- จะช่วยให้คุณสร้างเวิร์กโฟลว์การวิเคราะห์โดยการลากเครื่องมือเข้าไปในพื้นที่ทำงานการแก้ไขการเชื่อมต่อโดยการลากสายข้อมูลระหว่างเครื่องมือและการใช้มุมมองแบบอินไลน์ที่จะได้รับภาพรวมของการประมวลผลในปัจจุบัน.
- ข้อมูลสามารถลดลงในพื้นที่ทำงานสำหรับการนำเข้าทันที.
- นอกจากนี้ยังเพิ่มความสดต่อเครื่องมือแจ้งเตือนความคืบหน้าบาร์และตัวชี้วัดสถานะ.
- ข้อผิดพลาดมีการกำหนดธงที่มีข้อความขอความช่วยเหลือ (คำแนะนำเกี่ยวกับเครื่องมือเมื่อชี้ให้เห็นสีแดง).
ต้องการ
- Graphviz
ความคิดเห็นที่ไม่พบ