Bioinformatics Benchmark System

ภาพหน้าจอของซอฟแวร์:
Bioinformatics Benchmark System
รายละเอียดซอฟแวร์:
รุ่น: 3
วันที่อัพโหลด: 3 Jun 15
ผู้พัฒนา: Joe Landman
การอนุญาต: ฟรี
ความนิยม: 48

Rating: 4.0/5 (Total Votes: 1)

ชีวสารสนเทศศาสตร์ระบบเกณฑ์มาตรฐานเป็นความพยายามที่จะสร้างกรอบการทดสอบที่เหมาะสม, การทดสอบและข้อมูลที่จะช่วยให้ผู้ใช้และผู้ขายในการตรวจสอบประสิทธิภาพการทำงานของระบบของพวกเขา
สิ่งที่เรากำลังพยายามที่จะทำคือการสร้างกรอบการทำงานสำหรับการทดสอบและชุดหลักของการทดสอบว่าทั้งหมดสามารถดาวน์โหลดและใช้ในการตรวจสอบองค์ประกอบที่เฉพาะเจาะจงของผลการดำเนินงานระบบ
นอกจากนี้แหล่งที่มาเพื่อการทดสอบเหล่านี้ที่มีอยู่ภายใต้ GPL และโฮสต์บน Bioinformatics.org และปรับขนาดสารสนเทศ LLC ความคิดที่จะช่วยให้ผู้ใช้ผู้บริโภคนักพัฒนาระบบและอื่น ๆ เพื่อให้ง่ายต่อการสร้างและใช้การทดสอบที่มีความหมายสำหรับการวัดและเหตุผลการปรับแต่ง .
โจแลนด์จาก Scalable สารสนเทศ LLC ความคิดและเขียนรหัสต้นฉบับ เรากำลังมองหาข้อเสนอแนะเพิ่มเติมรหัสมาตรฐานการทดสอบชุดข้อมูลและอื่น ๆ
การทดสอบพื้นฐานปัจจุบันมีหลาย NCBI ระเบิดวิ่งวิ่ง HMMer หลายและความหลากหลายของคนอื่น ๆ เราวางแผนที่จะรวม ClustalW, X ตีคู่! เคมีต่าง ๆ การเปลี่ยนแปลงและการทดสอบที่เกี่ยวข้องเช่นเดียวกับคนอื่น ๆ หลาย
การทดสอบดังกล่าวเป็น LINPACK หรือ HPL ก็ไม่ได้ให้ตัวชี้วัดประสิทธิภาพที่มีความหมายหรือรูปแบบการพยากรณ์สำหรับสารสนเทศที่มีประสิทธิภาพสูง แต่น่าเสียดายที่ไม่ทำจำนวนของการทดสอบที่ผ่านมาและมุ่งเน้นมากขึ้น
ปัญหานี้เป็นปัญหาและเป็น LINPACK HPL เฉพาะทดสอบประสิทธิภาพในการดำเนินงานต่างๆเมทริกซ์ที่คุณมีรูปแบบการเข้าถึงหน่วยความจำปกติได้อย่างมีประสิทธิภาพและดำเนินการทางคณิตศาสตร์ที่เฉพาะเจาะจง
รหัสเหล่านี้มีประโยชน์มากที่สุดสำหรับการเปรียบเทียบรหัสกับการดำเนินงานจุดลอยหนักและการจราจรอัดหน่วยความจำ รหัสเหล่านี้ไม่ได้ถูกออกแบบมาสำหรับการเปรียบเทียบระบบที่ครอบคลุมที่ดิสก์ I / O แฝงหน่วยความจำและปัจจัยอื่น ๆ ทั้งหมดนำไปสู่​​ปัญหาประสิทธิภาพการทำงาน
การทดสอบที่ดีที่สุดคือคนที่มีความใกล้เคียงกับรหัสที่คุณจะทำงานบนเครื่อง การทดสอบตัวเองควรจะใกล้เคียงที่เหมาะสมเพื่อการดำเนินการที่แท้จริงของรหัสของคุณโดยใช้ข้อมูลจริง คุณอาจจำเป็นต้องตัดมันกลับมาเพื่อที่จะได้ระยะเวลาที่เป็นจริง
คุณควรจะมีส่วนย่อยที่เหมาะสมของขนาดข้อมูล ทดสอบเดียวไม่บอกคุณว่าระบบของคุณเครื่องชั่งน้ำหนักและเป็นหนึ่งในสาเหตุของการดำรงอยู่ของการทดสอบนี้เป็นพิเศษเพื่อให้คุณสามารถทดสอบประสิทธิภาพในขณะที่คุณเพิ่มแง่มุมต่าง ๆ ของภาระงาน
คุณไม่ค่อยได้รับระบบนิ่งในคลัสเตอร์ดังนั้นเราจึงอยากจะแนะนำให้คุณพยายามที่จะทำงานในเป็นจริงสภาพแวดล้อมการทำงานที่เป็นไปได้ พื้นฐานในระบบนิ่งดี แต่มันอาจจะตั้งความคาดหวังของคุณโดยไม่มีเหตุผลสมควร
ด้านบน

ซอฟต์แวร์ที่คล้ายกัน

AREM
AREM

11 May 15

PEATDB
PEATDB

14 Apr 15

Genepidgin
Genepidgin

20 Feb 15

STEPS
STEPS

15 Apr 15

ความคิดเห็นที่ Bioinformatics Benchmark System

ความคิดเห็นที่ไม่พบ
เพิ่มความคิดเห็น
เปิดภาพ!
ค้นหาตามหมวดหมู่