BioPerl

BioPerl ได้รับการพัฒนาในการประมวลผลข้อมูลทางชีวภาพใน Perl
มันเป็นเครื่องมือในการสำรวจความเป็นไปของ Perl ในโลกรส

มีอะไรใหม่ ในข่าวประชาสัมพันธ์ฉบับนี้.

• การปรับปรุงการสนับสนุนที่สำคัญของ Windows
• การปรับปรุง MAKER เพื่อให้ตาราง codon มาตรฐานที่เข้มงวด
• การสนับสนุนที่ดีขึ้นสำหรับลำดับวงกลม
• แก้ไขสำหรับบางประเภทสถานที่ตั้งที่ซับซ้อน
• ข้อผิดพลาดที่อยู่ในรูปแบบ contig GenBank
• แก้ไข Deobfuscator

มีอะไรใหม่ ในรุ่น 1.6.922.

• ที่อยู่ CPAN ความล้มเหลวในการทดสอบ
• เพิ่มการสนับสนุนสำหรับไฟล์ BIOPROJECT Genbank.
• การสนับสนุน regex ​​ที่ดีขึ้นสำหรับการส่งออก HMMER3.

มีอะไรใหม่ ในรุ่น 1.6.901:

• การใช้ AcePerl จะเลิก; Ace.pm ไม่ได้รับการบำรุงรักษาอย่างแข็งขันและโมดูลใช้ Ace ก็จะถูกเลิก.
• การแก้ไขข้อผิดพลาดเล็กน้อยปล่อย.
• ไบโอ :: SeqIO :: ทดสอบ gbxml ต้อง XML :: SAX.
• ปัญหาที่อยู่ Build.PL เมื่อ DBI ไม่อยู่.
• ข้าม gbxml.t และ InterPro ทดสอบเมื่อไม่ได้ติดตั้งโมดูล.
• ลบโค้ดสำหรับ Perl 5.14.0 compat.
• เนื่องจากการเปลี่ยนแปลงสคีและการขาดการสนับสนุนสำหรับรุ่นเก่า, การสนับสนุนสำหรับ NeXML 0.9 เป็นเพียง (มาก) ดำเนินการบางส่วน.